Het is het jaar 1850 en onze zwiepende legende wordt uitgedaagd om de meest gevaarlijke missie van zijn leven te voltooien.

Nadat hij geholpen heeft in het gevecht om Californie de 31ste staat van de Unie te laten worden, moet Zorro (Antonio Banderas) zich nu houden aan de belofte die hij aan zijn vrouw Elena (Catherina Zeta-Jones) heeft gedaan. Hij moet zijn geheime bestaan opgeven en een normaal leven gaan leiden als Alejandro de la Vega..
Maar hij kan de verleiding niet weerstaan als zijn oude vijanden dreigen een gevaar los te laten dat al 500 jaar in de maak is en de koers van de geschiedenis zal wijzigen.. Alleen Zorro kan het stoppen.